远古蜥蜴人回到地表后,开始迅速的建立起一座又一座城市,科学研究也得以开始发展。在不到2万年的时间里,远古蜥蜴人恢复到了比祖先巅峰时更大的规模,并重新掌控了地球。他们开始派遣舰队去寻找传说中抵达地球的神秘先祖,但最终由于技术的限制多次无果后只能放弃。
距今407万年,昴宿星人再次回到地球,第三次蜥蜴人和昴宿星人的战争爆发。这次昴宿星人的科技相比上次战争有着明显的提升,这场战争只进行了6年时间,远古蜥蜴人就宣布投降,这次是昴宿星人主动提出的劝降,根据昴宿星人所说,6500万年前恐龙的灭绝就是来自天龙星系一个叫做娜迦的种族所为,始祖蜥蜴人的出现也是基因改造的突变体。娜迦族就是蜥蜴人口口相传的创世神,那支神秘的远古蜥蜴人舰队也是娜迦族派出的。同时,昴宿星人和娜迦族在第二次蜥蜴人和昴宿星人战争结束后就签订过一份协议,他们共享了地球的开发权,在允许的情况下不会毁灭实验体种族,所以才会出现主动劝降的做法。但协议也规定,如果哪一方没管理好自己的实验体,导致违反协议约定,则必须亲自消灭或转移实验体。而协议的惩罚部分昴宿星人并没有告诉远古蜥蜴人。
正当远古蜥蜴人听从昴宿星人的命令都聚集到一起,等待创世神来接走他们,并庆幸自己有创世神庇佑的时候,娜迦族派遣的强大舰队再次来到了地球。这次他们只带走了少量的人口,然后毫不犹豫的消灭了剩下的远古蜥蜴人。到此,在地球上的远古蜥蜴人彻底灭亡。在往后的百万年岁月里,远古蜥蜴人作为娜迦族的多个神使附庸种族,在宇宙间穿梭,执行着创世神给他们的各种任务。这些神使种族,经过基因改造已经没有能力进一步进化,更做不到发展科技。他们只是供人驱使的傀儡,对于娜迦族而言只是一些失败的实验品罢了。
虽然远古蜥蜴人被强制带离了诞育他们的地球,之后又被娜迦族牢牢掌控,但过往的历史和记忆让他们始终思念着母星地球,祭奠着祖先的灵魂。因此,远古蜥蜴人总是定期的派出人员重返地球祭奠先祖,并关注着地球的发展。
往后的地球很平静,娜迦族在履行协议,接受惩罚期间,地球上只有昴宿星人的实验在进行着。
距今120万年,昴宿星人经过这么多年的培育,启动了地球上的第一次文明实验。他们挑选了当时能够直立行走,外貌也已经接近自己的猿人,进行再一次的基因改造。在扶持和引导了突变体族群长达3万年后,地球上的第二个智慧种族出现了,人类。在太平洋中间存在着一片大陆,名为姆大陆的地方,第一个人类文明开始建立。这个文明的发展速度很快,不到5万年的时间就从原始社会发展到了太空时代,当他们第一次看清楚地球的全貌时,信仰了多年的创世神思想受到了动摇,社会内部出现了挑战已经持续了长达万年的,宗教信仰的声音。随着科技的进一步发展,往后的1万年中,他们到访了火星,木星,甚至是海王星,科技快速发展带来的极度膨胀的种族自信,导致了彻底推翻神权的运动,这场运动持续了350年,最终所有最初由昴宿星人引导建立起来的信仰从主流社会中被彻底斩断,沦为小众人群所秘密信奉的宗教。
不知为何,地球上短短几百年的巨变,昴宿星人很快就知道了,1200年后,一支舰队抵达了太阳系。昴宿星人最初希望重新塑造自己创世神的形象来修正,大量派遣人员深入姆大陆社会,重新建立宗教分支,引导社会的发展方向。但在努力了200年后,没有达到预期的效果,于是舰队就降临了地球,用神的威慑来征服姆大陆人。开始姆大陆人在引导和威慑双重影响下出现了臣服的迹象,但是核武器的出现,让姆大陆人的自信再次占据上风,他们首先发起了进攻,并用核武器攻击了昴宿星人的舰队,舰队在没有做准备的情况下有部分受到了损伤,这让姆大陆人更加相信所谓的创世神只是个传说,这些外星人只是想借用姆大陆人曾经的信仰,来达到征服和控制的目的。于是一轮又一轮的核武器攻击开始了,但是再没有任何效果。狂热的姆大陆人最后不惜使用威力更大的武器来攻击,但这可能会导致地球的毁灭,这个行为彻底触怒了昴宿星人,他们接走了部分信仰坚定的姆大陆人,发动了一次灭世攻击。攻击引发了大陆上的火山喷发,大地崩裂,滔天的洪水淹没了整片大陆。就这样地球上的第一个人类文明,姆大陆文明灭亡了。部分流亡幸存的姆大陆人在没有了大陆文明的支撑下,退化和消亡,在其他大陆上也只留下了少量的遗迹。地球又进入了一段平静的时期。
距今约74万年,昴宿星人启动了地球上的第二次文明实验,由于此时的地球还处于第四纪冰期,而唯一的一块适合文明发展的大陆已经在30万年前被他们沉入海底,并使印度洋板块抬升,于是他们人为的将印度洋中的一个板块继续抬升到海平面上方,这片大陆后来被命名为雷姆利亚大陆。为了增加这个文明对创世神的认同度,他们在对猿人改造时,添加了更多自己种族的外貌特征。很快一个新的人类文明,雷姆利亚文明在这片广袤的大地上开始繁衍生息,在创世神的引导下,他